武汉大学Nature Genetics：棉花基因组进化历程

先知报道

2020-04-15

棉花是世界上最重要的经济作物之一。有鉴于此，武汉大学朱玉贤团队和美国农业部农业科学研究院John Z. Yu等研究人员，揭示了棉花基因组的进化历程。

本文要点

1）在组装了第一个药棉（A1）基因组并显着改善了现有的树棉（A2）和陆地棉（（AD）1）基因组后，研究人员证明了所有现有的A基因组都可能起源于一个共同的祖先。

2）A0与A1在系统发育上的相关性高于A2。此外，结果显示出异源四倍体形成先于A1和A2的形成。两种A基因组都是独立进化的，并没有祖先与后代的关系。

3）高斯概率密度函数分析表明，从570万年前至61万年前发生了数个长末端重复的爆发，对A基因组大小的扩展、物种形成和进化产生了显著贡献。

4）基因区域中丰富的物种特异性结构变异改变了许多重要基因的表达，这可能导致（AD）1中纤维细胞的改善。

这些发现解决了围绕A基因组起源的现有争议概念，并为棉花遗传改良提供了宝贵的基因组资源。

参考文献：

Gai Huang, et al. Genome sequence of Gossypium herbaceum and genome updates of Gossypium arboreum and Gossypium hirsutum provide insights into cotton A-genome evolution. Nature Genetics, 2020.

DOI：10.1038/s41588-020-0607-4

https://www.nature.com/articles/s41588-020-0607-4