Nature Methods：CRISPR技术再创新应用

先知报道

2019-11-26

我们将基因型变异与生物学上重要的表型联系起来的能力受到了活细胞显微镜和文库规模的基因组工程之间的差距的严重限制。近日，瑞典乌普萨拉大学Johan Elf 和Michael J. Lawson的研究团队合作，研究开发出基于时间分辨成像的CRISPRi筛选技术。研究人员展示了如何克服在微流控设备中经过延时成像后的菌株文库原位基因分型的问题。他们通过监测平均每个敲低大于500个细胞周期的复制叉的位置，来确定235种不同的CRISPR干扰敲低如何影响大肠杆菌复制和分裂周期的协调。随后的原位基因分型使他们能够将每种表型分布图定位到特定的遗传扰动，以确定哪些基因对细胞周期控制很重要。单细胞时间分辨实验使他们能够确定单细胞生长速率，细胞分裂大小和复制起始体积的分布。这项研究中介绍的技术可以实现大多数活细胞显微镜检法的基因组规模筛选。

Daniel Camsund, Michael J. Lawson, Jimmy Larsson, et al. Time-resolved imaging-based CRISPRi screening. Nature Methods, 2019.

DOI: 10.1038/s41592-019-0629-y

https://www.nature.com/articles/s41592-019-0629-y