Nature Catalysis:逆羟醛缩合催化反应和代谢过程模拟

生命的产生是科学中最基础的问题,在该过程中分子的自复制过程具有重要意义,并且自复制是化学转变为生物学中的关键步骤,但是该过程中需要其他功能才能演化出生命。催化过程是其中重要的一种功能,目前荷兰格罗宁根大学Clemens Mayer,Sijbren Otto等展示了催化反应和自我复制中的混杂过程如何实现催化作用。特别的,作者发现自组装得到的复制体通过反羟醛反应(retro-aldol reaction)/切断芴基甲氧基羰基的过程,并且该反应会对自复制过程产生正向反馈作用。这种过程为从分子级别理解生命的起源提供了重要一步。
自复制纤维材料的催化反应。分别考察了2号分子(α-萘甲醇丙酮)在Lys-NH2催化作用中的逆羟醛反应, 4号分子(芴基甲氧基羰基-甘氨酸)在Brønsted碱催化中的切断反应。在2号分子的逆羟醛反应中,作者发现当在反应体系中加入自复制纤维材料16(50 μM)和200 μM反应物后,在25 ℃中迅速反应并生成产物。并且该催化反应中的催化作用是通过自复制材料产生的,作者认为16在局部产生了较高的局域正电荷,改善了反应微环境,并促使其催化活性的产生。此外,相对于非组装的结构,纤维状16提供更好的微环境和催化剂结合位点。
在对4号分子(芴基甲氧基羰基-甘氨酸)的FMOC切断反应模拟形成原始代谢体系的反应中,作者发现存在16的催化体系中纤维自复制体(16)n在进行FMOC切断后生成了芴基乙烯5号分子。这种烯烃分子会提高纤维自组装复制过程的速率。作者通过相关实验验证了反应生成的5号烯烃分子通过改善1号分子中巯基氧化生成含有S-S的聚合物过程,有效的促进了生成纤维自复制体的速度。
参考文献
Jim Ottelé, Andreas S. Hussain, Clemens Mayer* & Sijbren Otto*
Chance emergence of catalytic activity and promiscuity in a self-replicator, Nature Catalysis 2020
DOI:10.1038/s41929-020-0463-8
https://www.nature.com/articles/s41929-020-0463-8
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