Nature Biotechnology：可鉴定RNA测序中单分子年龄的新技术

先知报道

2020-10-26

目前的单细胞RNA测序（RNA-seq）方法仅提供有关基因表达动态的有限信息。有鉴于此，美国哈佛大学的Fei Chen和麻省理工学院的Edward S. Boyden等研究人员，开发出可鉴定RNA测序中单分子年龄的新技术。

本文要点

1）研究人员报道了RNA时间戳，一种通过利用RNA编辑来推断RNA序列数据中单个RNA年龄的方法。

2）为了引入时间戳，研究人员用带有多个MS2结合位点的报告基序来标记RNA，该结合位点募集与MS2衣壳蛋白融合的腺苷脱氨酶ADAR2。ADAR2与标记RNA的结合会导致A-to-I编辑随着时间的推移而积累，从而可以小时刻度精度推断出RNA的年龄。

3）通过结合同一启动子驱动下多个带有时间戳RNA的观察，研究人员可以确定启动子何时处于活动状态。研究人员证明该系统可以推断多个过去的转录事件的存在和时间。

4）研究人员根据过去转录活动的时间，将该方法应用于单个细胞的聚类。

本文研究表明，RNA时间戳将允许将时间信息整合到RNA序列工作流程中。

参考文献：

Samuel G. Rodriques, et al. RNA timestamps identify the age of single molecules in RNA sequencing. Nature Biotechnology, 2020.

DOI：10.1038/s41587-020-0704-z

https://www.nature.com/articles/s41587-020-0704-z