Nature Biotechnology：染色质修饰在分化和肿瘤进展中的单细胞CUT＆Tag分析技术
先知报道
定量建立单细胞中基因表达和染色质可及性的方法已经建立，但是具有特定组蛋白修饰的染色质区域的单细胞分析在技术上具有挑战性。有鉴于此，美国华盛顿大学的Anoop P. Patel和美国弗雷德·哈钦森癌症研究中心的Steven Henikoff等研究人员，建立了染色质修饰在分化和肿瘤进展中的单细胞CUT＆Tag分析技术。
本文要点
1）研究人员将CUT＆Tag方法调整为可扩展的基于纳孔和基于液滴的单细胞平台，以描绘复杂组织中的单细胞（scCUT＆Tag）以及人类胚胎干细胞分化过程中的染色质景观。
2）研究人员专注于分析在单个细胞中以组蛋白H3 Lys27三甲基化（H3K27me3）为标记的多梳基团（PcG）沉默区域，作为染色质可及性的正交方法来鉴定细胞状态。
3）研究显示H3K27me3的scCUT＆Tag分析可区分人血中的细胞类型，并允许从异质组织生成特定细胞类型的PcG景观。
4）研究人员使用scCUT＆Tag对治疗前后脑肿瘤患者的H3K27me3进行了分析，鉴定了肿瘤微环境中的细胞类型以及主要样品和治疗后PcG活性的异质性。
参考文献：
Steven J. Wu, et al. Single-cell CUT&Tag analysis of chromatin modifications in differentiation and tumor progression. Nature Biotechnology, 2021.
DOI：10.1038/s41587-021-00865-z
https://www.nature.com/articles/s41587-021-00865-z
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