Nature Biotechnology：在人体组织中以高时间分辨率进行细胞谱系追踪波动甲基化时钟

先知报道

2022-01-12

记录细胞祖先的分子钟突变太慢，无法测量成体组织中细胞更新的短时间尺度动态。有鉴于此，美国南加州大学的Darryl Shibata、英国伦敦玛丽女王大学的Trevor A. Graham和美国莫菲特癌症中心的Alexander R. A. Anderson等研究人员，在人体组织中以高时间分辨率进行细胞谱系追踪波动甲基化时钟 (FMC)。

本文要点

1）研究人员研究表明波动的 DNA 甲基化标记可以用作细胞中的时钟，其中正在进行的甲基化和去甲基化导致甲基化和非甲基化状态之间重复“触发器”。

2）研究人员使用标准甲基化阵列识别内源性波动 CpG (fCpG) 位点，并开发数学模型以从这些数据中定量测量成人干细胞动力学。

3）推测小肠隐窝含有比结肠略多的干细胞，小肠中的干细胞置换速度较慢。

4）种系 APC 突变增加了每个隐窝的替换数量。研究人员测量了血液中急性白血病的快速扩张和慢性病的缓慢增长。

本文研究表明，人类体细胞生成和死亡的模式可以通过(FMC)进行测量。

参考文献：

Calum Gabbutt, et al. Fluctuating methylation clocks for cell lineage tracing at high temporal resolution in human tissues. Nature Biotechnology, 2021.

DOI：10.1038/s41587-021-01109-w

https://www.nature.com/articles/s41587-021-01109-w