Nature Biotechnology：用于癌症相关单核苷酸变体的高通量工程化和功能分析的碱基编辑传感器库
先知报道
2022-03-02
本文要点
1）研究人员描述了模块化的碱基编辑活性"传感器"，它将单向导RNA（sgRNA）和同源的目标位点顺式连接起来，并利用它们来系统地测量成千上万的sgRNA与功能不同碱基编辑器配对的编辑效率和精度。
2）通过量化超过200,000个编辑器-sgRNA组合的传感器编辑，研究人员提供了一个全面的sgRNA资源，用于在多个模型系统中引入和研究癌症相关的单核苷酸变异。
3）研究人员证明，经过传感器验证的工具可以简化体内癌症模型的产生，并且在集合的sgRNA库中整合传感器模块可以帮助解释高通量碱基编辑筛选。
4）使用这种方法，研究人员确定了几个以前未被描述的突变TP53等位基因作为癌细胞增殖和体内肿瘤发展的驱动因素。
本文研究表明，该框架将有助于在细胞和动物模型中对癌症变体进行功能研究。
参考文献：
Francisco J. Sánchez-Rivera，et al. Base editing sensor libraries for high-throughput engineering and functional analysis of cancer-associated single nucleotide variants. Nature Biotechnology, 2022.
DOI：10.1038/s41587-021-01172-3
https://www.nature.com/articles/s41587-021-01172-3
版权声明：
本平台根据相关科技期刊文献、教材以及网站编译整理的内容，仅用于对相关科学作品的介绍、评论以及课堂教学或科学研究，不得作为商业用途。
