Cancer Cell：单细胞图谱显示出肿瘤间和肿瘤内异质性的不同保留

先知报道

2022-04-09

GBM是一种侵袭性脑肿瘤，其特点是广泛的瘤间和瘤内异质性。最近，患者衍生的模型，如类器官和外植体，已成为研究这种异质性的有用模型，尽管它们能在多大程度上再现GBM的基因组特征仍不清楚。有鉴于此，加拿大英属哥伦比亚大学的Marco A. Marra等研究人员，最新工作表明，原发性胶质母细胞瘤和相匹配的外植体和细胞系的单细胞图谱显示出肿瘤间和肿瘤内异质性的不同保留。

本文要点

1）研究人员分析了12个IDH野生型胶质母细胞瘤（GBM）（包括两个复发的肿瘤）的批量外显子和单细胞基因组和转录组谱，以及来自这些肿瘤的患者衍生外植体（PDE）和胶质瘤（GS）系。

2）研究人员发现，PDE在基因上与它们的母体肿瘤相似，并不同程度地保留了基因表达特征。

3）值得注意的是，与它们的母体肿瘤相比，PDE似乎表现出类似的转录异质性水平，而GS系往往富含转录状态更均匀的细胞。

本文研究的方法和数据集将提供一个宝贵的资源，帮助指导使用GBM衍生模型的实验，特别是在研究细胞异质性方面。

参考文献：

Véronique G. LeBlanc, et al. Single-cell landscapes of primary glioblastomas and matched explants and cell lines show variable retention of inter- and intratumor heterogeneity. Cancer Cell, 2022.

DOI：10.1016/j.ccell.2022.02.016

https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(22)00068-X