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南大Nature Nanotechnol：纳米孔探测酶切核苷单磷酸

纳米技术
2022-07-21


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对RNA进行修饰在调节各种生物过程中起到关键作用，并且与许多人类疾病有关。但是目前直接通过测序的方式直接鉴定RNA的修饰情况仍具有较高的挑战。纳米孔测序技术是一种具有前景的技术，目前的技术通常需要复杂的序列解码。通过序列纳米孔鉴定酶切核苷单磷酸能够提供非常准确的序列信息和RNA修饰情况。

有鉴于此，南京大学黄硕等报道一种苯硼酸修饰的杂八聚体Mycobacterium smegmatis porin A纳米孔，这种方法能直接区别核苷单磷酸、5-甲基胞苷、N6-甲基腺苷、N7-甲基鸟苷、N1-甲基腺苷、肌苷、假尿苷和二氢尿苷。

本文要点

（1）

通过相关报道准确率达到0.996的机器学习方法对microRNA和自然转移RNA进行定量分析，这种方法在多种核苷或核苷酸衍生物的检测过程中表现非常好的结果，为RNA序列的表观遗传测序提供一种新方法。

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参考文献

Wang, Y., Zhang, S., Jia, W. et al. Identification of nucleoside monophosphates and their epigenetic modifications using an engineered nanopore. Nat. Nanotechnol. (2022)

DOI: 10.1038/s41565-022-01169-2

https://www.nature.com/articles/s41565-022-01169-2




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