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Cell:复杂组织中单个细胞的空间分辨表观基因组分析

吴宗涵
2022-10-23


随着空间组学方法的不断发展,转录组和3D基因组组织的单细胞定位开始实现了高空间分辨率。空间解析的单细胞表观基因组学方法扩大了空间组学工具的储备,将极大地加速对细胞和组织功能的空间调控的理解。近日,来自哈弗大学医学院庄小威团队首次开发了一种利用原位标记和转录以及多重成像对单个细胞进行空间分辨表观基因组定位的方法。

文章要点:

1) 研究证实在单个细胞中鉴定组蛋白修饰标记活性启动子、推定增强子和沉默启动子的能力,并在胚胎和成年小鼠大脑中生成了数百个活性启动子和推定增强器的高分辨率空间图谱;

2) 推定的启动子-增强子对和增强子枢纽可以调控发育重要基因,研究者们认为这种方法将普遍适用于表观遗传修饰和DNA结合蛋白的空间定位,从而提高对表观基因组如何时空调控基因表达的理解。

参考资料:

Zhuang, X.W., et al. Spatially resolved epigenomic proling of single cells in complex tissues. Cell. (2022).

DOI: 10.1016/j.cell.2022.09.035

https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.09.035



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